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目前台灣有兩種流行性腦膜炎雙球菌疫苗，一種是 4價結合型疫苗 (Meningococcal serogroups A, C, W, and Y oligosaccharide diphtheria CRM conjugate vaccine, Menveo, GSK)，可預防A, C, Y, W-135等4種血清型，適用於12個月以上2至55歲的兒童或成年人，注射1劑。另一種是針對B型的四成份重組蛋白疫苗 (Meningococcal serogroup B vaccine, Bexsero, GSK)，兩個月以上之民眾均可考慮接種腦膜炎雙球菌疫苗，尤其是嬰幼兒以及密集團體生活者(如軍隊、監獄)，初次疫苗接種建議施打2劑，間隔至少4週。非洲及亞洲地區以A、C血清群占大多數，美國、歐洲及澳洲等國流行之血清群則以B或C型為主。